Die APE-Dateierweiterung wird am häufigsten mit Sound- oder Musikdateien verknüpft, die mit Monkey's Audio, einem verlustfreien Audiokomprimierungsalgorithmus, komprimiert wurden. Obwohl weniger häufig, wird die APE-Dateierweiterung auch von Advanced Visualization Studio (AVS) verwendet, einem visuellen Winamp-Plugin eines Drittanbieters.
Im Gegensatz zu den meisten Audiokomprimierungsalgorithmen ist Monkeys Audio verlustfrei, was bedeutet, dass Dateien, die das Format verwenden, die gesamte Qualität des Originals beibehalten. Neben dem Vorteil von hoher Audioqualität bei kleineren Dateigrößen können APE-Dateien auch verlustfrei in ihr Originalformat zurückkonvertiert werden. Wie andere komprimierte Audioformate unterstützen auch APE-Dateien die Fehlererkennung und -kennzeichnung. Dies bedeutet, dass Informationen wie Künstler und Songtitel an die Datei angehängt werden können. Der Audio-Encoder von Monkey ist frei verfügbar, sodass jeder Softwareentwickler Software erstellen kann, die APE-Audiodateien ausgibt.
Die meisten gängigen Audiokomprimierungsformate wie File extension MP3, File extension WMA und File extension OGG Vorbis sind als verlustbehaftet bekannt. Dies bedeutet, dass während des Konvertierungsprozesses Informationen verworfen werden, um die Dateigröße mithilfe einer als Wahrnehmungscodierung bekannten Technik zu reduzieren. Die Theorie hinter der Wahrnehmungscodierung lautet, dass nicht alle Geräusche vom menschlichen Ohr wahrgenommen werden. Da diese Informationen nicht für eine originalgetreue Wiedergabe der ursprünglichen Audiospur benötigt werden, können sie verworfen werden, um die Größe der resultierenden Datei zu verringern . Dies wirkt sich zwar nicht nachteilig auf die Klangqualität aus, diese Informationen gehen jedoch für immer verloren und können daher nicht wiederhergestellt werden, wenn die Datei wieder in das ursprüngliche Format konvertiert wird.
Monkeys Audio kann verwendet werden, um APE-Dateien zu öffnen und in andere Formate zu konvertieren. Viele andere Mediaplayer können auch zum Öffnen von APE-Dateien mit dem entsprechenden Codec wie Winamp, JMAC, Media Monkey und Windows Media Player verwendet werden, wobei ein Codec-Paket wie K-Lite oder das kombinierte Community-Codec-Paket hinzugefügt wird.